軟膏制劑凈化車間應按工藝流程合理布局，人流、物流要分開，上下工序的聯系、交接要方便，盡量避免生產過程中原輔包裝材料及半成品的重復往返，防止交叉感染。凈化車間的墻面、地面、天花板，應選用表面光滑易于清洗的材料，應平整光滑、無死角，無顆粒性物料脫落、無霉斑、易清洗、易消毒，并有防塵、防蚊蠅、防蟲鼠等措施；一般可使用紅鋼瓷磚或水磨石地面等耐酸耐堿材料；內墻和平頂可采用苯丙涂料或瓷釉涂料；墻面和地面接縫處應呈圓弧形，并應嵌入墻角；濕度較大的工序的內墻也可以用部分或全部瓷磚作墻面，施工時砂漿必須飽滿，以減少縫隙。

無菌外用軟膏劑的配置、分裝應在100或者局部100的凈化車間內，可采用層流室或在1萬級的環境中設置局部100的層流裝置，并嚴格無菌操作要求；一般表皮用軟膏劑其暴露工序為30萬，可采用兩個中效凈化系統，室內換氣次數每小時10次以上；用于深部組織創傷和大面積體表創面用的軟膏劑的暴露工序應在10萬凈化車間的操作，采用初效、中效、亞高效等三級潔凈空調，換氣次數可為20-50次/H；眼膏劑的軟管的清洗、配置、灌裝等工序應為1萬級的凈化車間，可采用初效、中效、亞高效三級潔凈空調，換氣次數為50-80次/H。中凈環球凈化提供制劑凈化車間的咨詢、規劃、設計、施工裝修等配套服務。

有潔凈度要求的凈化車間的主體應在溫度變化和振動情況下，不易產生裂紋和縫隙，門窗結構應簡單而密閉，并與室內墻面齊平，防止塵埃小粒子從外部滲入和方便清洗。門應朝潔凈度高的方向開啟，鋼板門強度高、光滑、易清潔，但要求漆膜牢固，能耐消毒水擦洗；蜂窩貼塑門的表面平整光滑、易清潔、造型簡單、且面材耐腐蝕；傳遞窗宜采用雙斗式，密封性較好；窗戶盡量采用大玻璃，不僅為操作人員提供敞亮愉快的環境，也便于管理人員通過窗戶觀察操作情況，目前常用鋼窗和鋁合金窗；無菌潔凈區的門不宜用木制，木材遇濕易長菌生霉。